三代基因測序頻獲融資 錯誤率及成本高制約商用
原標(biāo)題:三代基因測序融資頻爆錯誤率、成本高制約商用
本報(bào)記者肖玫麗廣州報(bào)道
二代測序還未唱罷,三代測序就已登臺。
上周,北京希望組宣布完成由經(jīng)緯中國和賽富投資領(lǐng)投、清科創(chuàng)投跟投的近億元人民幣A輪融資。12月12日,英國公司Oxford Nanopore Technologies宣布在最近一輪融資中獲得了1億英鎊(合計(jì)1.26億美元)融資。
12月13日,第三代基因測序儀開發(fā)商、深圳市瀚海基因生物科技有限公司市場營銷副總監(jiān)康炎向21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報(bào)道記者透露:“目前,瀚海的融資額已過億,前陣子還獲得了深圳科創(chuàng)委提供的4000萬元補(bǔ)助。”
如今,三代基因測序公司在資本市場上開始嶄露頭角。不過,與目前主流的二代測序相比,三代測序仍存在錯誤率高、成本高、現(xiàn)有生物信息學(xué)分析軟件不豐富等問題,商業(yè)應(yīng)用很難開展。在未來幾年,二代測序或依舊占據(jù)主流地位。
頻獲融資
基因測序已經(jīng)歷了三代技術(shù)革命,主要有一代測序(Sanger測序)、二代測序(illumina和Life Tech)、三代測序(單分子測序)。
其中,二代測序應(yīng)用最為廣泛,如華大基因等公司采用;一代測序雖然通量有限,但出于精確度高,仍然占據(jù)部分市場。三代測序,即無需PCR擴(kuò)增的單分子測序技術(shù)也已問世。
康炎告訴21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報(bào)道記者:“三代測序的原理在2003年就發(fā)表了,由于太超前,賣得不是很好?,F(xiàn)在市場中有三種技術(shù)路線,共同的優(yōu)點(diǎn)是不需要擴(kuò)增PCR,也不需像二代測序一樣建庫。”
國外布局三代測序的主要有三家,Helicos公司的Heliscope單分子測序儀、Pacific Biosciences公司的SMRT技術(shù)和Oxford Nanopore Technologies公司的納米孔單分子技術(shù)。其中,Helicos公司由單分子測序領(lǐng)域泰斗級人物Stephen Quake教授于2004年創(chuàng)辦,并于2012年破產(chǎn)。
國內(nèi)企業(yè)也在加速三代測序技術(shù)的研發(fā)。去年10月底,瀚?;蚬剂嘶贖elicos 技術(shù)研發(fā)的專門用于臨床的第三代單分子測序儀GenoCare 原理樣機(jī),中科院北京基因組研究所與浪潮基因組科學(xué)聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室也在共同研制國產(chǎn)三代基因測序儀。
“兩家外資公司的技術(shù)通量低、讀長長,做病毒、細(xì)菌全基因組測序較好,但傳統(tǒng)的無創(chuàng)產(chǎn)篩等醫(yī)學(xué)應(yīng)用做不了。瀚海的產(chǎn)品不適合做超長讀長的測序,但是通量高,跟他們的技術(shù)是互補(bǔ)的。”康炎進(jìn)一步說。
三代測序的研發(fā)成本也不低。以此次獲得1億英鎊融資的Oxford Nanopore Technologies為例,其融資總額達(dá)到了3.51億英鎊。
國內(nèi)企業(yè)也一樣。截至2016年初,成立僅三年的瀚?;蛲ㄟ^三輪融資和政府撥款,共計(jì)獲得1.2億元融資。不久前,深圳市2016年海外高層次人才“孔雀團(tuán)隊(duì)”(第一批)名單公示,瀚?;蛭涣衅渲校佾@4000萬元資助。
據(jù)康炎透露:“三代測序的研發(fā)成本很高,單一技術(shù)都需要上億投入。我們還在繼續(xù)融資。”
商業(yè)化為時過早
雖然已經(jīng)出現(xiàn)了樣機(jī),但國產(chǎn)三代測序儀還沒實(shí)現(xiàn)商業(yè)化,外資測序儀的商業(yè)化也處于起步階段。
高特佳投資執(zhí)行合伙人王海蛟認(rèn)為:“三代測序技術(shù)還在優(yōu)化。其中最主要的問題是精度達(dá)不到要求,這使得其短期內(nèi)商用價(jià)值不大。”
興證醫(yī)藥研報(bào)也指出,第三代基因測序存在缺陷:單讀長錯誤率依然偏高,錯誤率在15%-40%,而二代測序的錯誤率低于1%。
康炎坦言:“錯誤率現(xiàn)在還在逐步解決,英國企業(yè)的錯誤率是50%左右,美國13%以上,但瀚海的技術(shù)路線類似二代測序,錯誤率也快接近二代測序水平。”
另外,三代測序技術(shù)成本較高,二代Illumina的測序成本是每100萬個堿基0.05-0.15美元,三代測序成本是每100萬個堿基0.33-1.00美元;生信分析軟件不夠豐富;依賴DNA聚合酶的活性等問題。
不過,三代測序的測序儀價(jià)格和測序成本降幅很快。Pacific Biosciences2011年推出第一臺三代測序儀PacBio RS,在美國價(jià)格為80萬美金,而在2015年生產(chǎn)的sequel測序儀價(jià)格則降到35萬美金。預(yù)計(jì)未來5年內(nèi),三代測序能達(dá)到100美元全基因組測序的價(jià)格,遠(yuǎn)低于現(xiàn)在1000美元的費(fèi)用。
“成本高主要因?yàn)檫M(jìn)口價(jià)格高,國產(chǎn)設(shè)備研發(fā)完成就可以降低。明年上半年,我們的設(shè)備會進(jìn)醫(yī)院系統(tǒng)試用、測試,”康炎告訴21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報(bào)道記者,“總有一天會與二代測序持平,但需要5到10年的時間。而在科研領(lǐng)域,現(xiàn)在三代已經(jīng)可以超越二代。” 以上就是關(guān)于“三代基因測序頻獲融資 錯誤率及成本高制約商用”的內(nèi)容,希望大家看的開心,看的愉快,也希望大家能夠積極的分享本網(wǎng)站,讓更多的人看到本站的“三代基因測序頻獲融資 錯誤率及成本高制約商用”內(nèi)容,謝謝!
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